Монгол Улсын Төсвийн тухай хуулийн 69 дүгээр зүйлд “төсвийн ерөнхийлөн захирагч бүр хууль тогтоомжийн хэрэгжилтэд хяналт тавих,төсвийн хөрөнгө, өр, төлбөр, орлого, зарлага, хөтөлбөр, арга хэмжээ, хөрөнгө оруулалтад санхүүгийн хяналт, шалгалт хийх, үнэлэлт, дүгнэлт,зөвлөмж гаргах, эрсдэлийн удирдлагаар хангахад чиглэсэн дотоод аудитын албыг байгуулж, дотоод аудитор ажиллуулна.”гэж заасны дагуу Засгийн газрын 2012 оны 129 дүгээр тогтоолоор “Дотоод аудитын дүрэм”-ийг баталж, дүүргийн Засаг даргын 2025 оны A/662 дугаар захирамжаар Засаг даргын дэргэдэх Дотоод аудитын албаны бүтцийг баталсан.